《小窗幽记》全书共分十三卷。每卷含清言数十段乃至二百段不等，皆以人生某个问题统领全卷。特以“醒字为全集之首，其中自有其深意。醒发之于醉，因此当其”趋名者醉于朝，趋利者醉于野，豪者醉于声色车马“之时”，“醒”字便不啻为一贴清凉散。“醒”又必与“悟”字相连。故而“悟”则为全书的主旨。
《小窗幽记》中不是没有偶一闪现的思想火花，但它却宁愿将其化为冷竣的一笑，豁达的宽容，乃至自我调侃，有时甚至带有相当多的消极、颓唐和及时行乐的思想糟粕。过分执着于自我，耽沉于身边琐碎小事，因而有时内容肤浅，格调不高。这与我们今天所处的环境自然是格格不入的。这是我们在读这本书，乃至欣赏整个晚明小品时尤其要注意的。